Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX2P28328 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX2P28328 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX2P28328 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX2P28328 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX2P28328 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX2P28328 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX2P28328 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX2P28328 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX2P28328 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX2P28328 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX2P28328 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX2P28328 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX2P28328 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX2P28328 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX2P28328 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX2P28328 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX2P28328 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX2P28328 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX2P28328 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX2P28328 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX2P28328 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX2P28328 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEX2P28328 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms