Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms