Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms