Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 RTN1-203ENST00000395090 1609 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AC003986.3-201ENST00000417460 692 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 PSMG2-210ENST00000590217 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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