Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODC1P11926 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms