Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms