Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPBP07199 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPBP07199 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPBP07199 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPBP07199 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPBP07199 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPBP07199 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPBP07199 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPBP07199 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPBP07199 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPBP07199 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPBP07199 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPBP07199 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPBP07199 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPBP07199 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPBP07199 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPBP07199 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPBP07199 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPBP07199 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPBP07199 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPBP07199 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPBP07199 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPBP07199 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPBP07199 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPBP07199 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPBP07199 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPBP07199 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPBP07199 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CENPBP07199 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CENPBP07199 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CENPBP07199 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPBP07199 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPBP07199 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPBP07199 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPBP07199 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPBP07199 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPBP07199 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPBP07199 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPBP07199 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPBP07199 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPBP07199 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPBP07199 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPBP07199 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPBP07199 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPBP07199 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPBP07199 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPBP07199 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPBP07199 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPBP07199 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPBP07199 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPBP07199 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPBP07199 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPBP07199 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPBP07199 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPBP07199 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPBP07199 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPBP07199 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBP07199 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBP07199 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBP07199 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBP07199 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBP07199 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBP07199 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBP07199 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBP07199 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBP07199 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBP07199 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBP07199 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBP07199 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBP07199 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBP07199 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBP07199 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBP07199 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBP07199 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBP07199 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBP07199 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBP07199 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBP07199 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBP07199 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBP07199 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBP07199 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBP07199 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBP07199 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBP07199 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBP07199 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPBP07199 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPBP07199 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPBP07199 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPBP07199 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPBP07199 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPBP07199 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPBP07199 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPBP07199 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPBP07199 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPBP07199 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPBP07199 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPBP07199 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPBP07199 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPBP07199 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPBP07199 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms