Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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