Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms