Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms