Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms