Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms