Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG68

TTL, Tubulin--tyrosine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLQ8NG68 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLQ8NG68 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms