Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HJURPQ8NCD3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms