Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF182Q8N6D2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF182Q8N6D2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF182Q8N6D2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF182Q8N6D2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF182Q8N6D2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RNF182Q8N6D2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RNF182Q8N6D2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms