Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms