Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms