Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms