Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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