Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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GPS1Q13098 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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