Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms