Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF3P61204 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF3P61204 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms