Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.9 ms