Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP17L13C9JLJ4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP17L13C9JLJ4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
USP17L13C9JLJ4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP17L13C9JLJ4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms