Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L9A6NEM1 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L9A6NEM1 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L9A6NEM1 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L9A6NEM1 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L9A6NEM1 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L9A6NEM1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L9A6NEM1 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L9A6NEM1 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L9A6NEM1 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L9A6NEM1 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L9A6NEM1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L9A6NEM1 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L9A6NEM1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L9A6NEM1 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L9A6NEM1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L9A6NEM1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GOLGA6L9A6NEM1 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms