Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAI2Q9Y5P3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms