Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HDGFL3Q9Y3E1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms