Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPRSS4Q9NRS4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMPRSS4Q9NRS4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms