Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlr5Q9JLF7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlr5Q9JLF7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms