Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ldb3Q9JKS4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms