Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Stx6Q9JKK1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stx6Q9JKK1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.5 ms