Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dap3Q9ER88 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Dap3Q9ER88 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms