Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbe1Q9D6Y9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbe1Q9D6Y9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms