Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc94Q9D6J3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc94Q9D6J3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc94Q9D6J3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms