Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A5Q9BY07 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms