Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB6Q9BUF5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB6Q9BUF5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB6Q9BUF5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB6Q9BUF5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB6Q9BUF5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB6Q9BUF5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB6Q9BUF5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB6Q9BUF5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB6Q9BUF5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB6Q9BUF5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB6Q9BUF5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB6Q9BUF5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB6Q9BUF5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB6Q9BUF5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBB6Q9BUF5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB6Q9BUF5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms