Protein–RNA interactions for Protein: Q99LC9

Pex6, Peroxisome assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex6Q99LC9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pex6Q99LC9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pex6Q99LC9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pex6Q99LC9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pex6Q99LC9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pex6Q99LC9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pex6Q99LC9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pex6Q99LC9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pex6Q99LC9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pex6Q99LC9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pex6Q99LC9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pex6Q99LC9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms