Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apobec3Q99J72 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apobec3Q99J72 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.1 ms