Protein–RNA interactions for Protein: Q92621

NUP205, Nuclear pore complex protein Nup205, humanhuman

Predictions only

Length 2,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP205Q92621 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP205Q92621 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP205Q92621 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP205Q92621 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP205Q92621 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP205Q92621 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP205Q92621 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP205Q92621 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP205Q92621 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP205Q92621 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP205Q92621 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP205Q92621 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP205Q92621 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP205Q92621 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP205Q92621 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP205Q92621 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP205Q92621 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP205Q92621 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP205Q92621 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP205Q92621 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NUP205Q92621 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NUP205Q92621 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP205Q92621 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP205Q92621 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms