Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD60

UPF0583 protein C15orf59 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CD60 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8CD60 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8CD60 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8CD60 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Q8CD60 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Q8CD60 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8CD60 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8CD60 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8CD60 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8CD60 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8CD60 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8CD60 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8CD60 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8CD60 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8CD60 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8CD60 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8CD60 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8CD60 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8CD60 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8CD60 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8CD60 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8CD60 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8CD60 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8CD60 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8CD60 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8CD60 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8CD60 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8CD60 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8CD60 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8CD60 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CD60 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CD60 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CD60 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CD60 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CD60 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CD60 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CD60 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8CD60 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8CD60 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8CD60 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8CD60 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8CD60 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CD60 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CD60 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CD60 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CD60 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CD60 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q8CD60 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8CD60 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8CD60 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8CD60 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8CD60 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8CD60 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8CD60 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8CD60 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8CD60 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8CD60 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8CD60 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8CD60 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8CD60 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8CD60 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8CD60 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8CD60 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8CD60 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CD60 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CD60 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CD60 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CD60 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CD60 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CD60 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CD60 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CD60 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CD60 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CD60 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CD60 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CD60 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8CD60 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8CD60 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8CD60 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8CD60 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8CD60 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8CD60 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8CD60 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8CD60 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8CD60 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8CD60 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8CD60 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8CD60 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8CD60 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q8CD60 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q8CD60 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q8CD60 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8CD60 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8CD60 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8CD60 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8CD60 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8CD60 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8CD60 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8CD60 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8CD60 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms