Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp37Q8C0R0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp37Q8C0R0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp37Q8C0R0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp37Q8C0R0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp37Q8C0R0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp37Q8C0R0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp37Q8C0R0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp37Q8C0R0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp37Q8C0R0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp37Q8C0R0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp37Q8C0R0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp37Q8C0R0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp37Q8C0R0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp37Q8C0R0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp37Q8C0R0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp37Q8C0R0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp37Q8C0R0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp37Q8C0R0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp37Q8C0R0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp37Q8C0R0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp37Q8C0R0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp37Q8C0R0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp37Q8C0R0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms