Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pja2Q80U04 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pja2Q80U04 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pja2Q80U04 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pja2Q80U04 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pja2Q80U04 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pja2Q80U04 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pja2Q80U04 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pja2Q80U04 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pja2Q80U04 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pja2Q80U04 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pja2Q80U04 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pja2Q80U04 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pja2Q80U04 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pja2Q80U04 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pja2Q80U04 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pja2Q80U04 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pja2Q80U04 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pja2Q80U04 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pja2Q80U04 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms