Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmcc1Q69ZZ6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmcc1Q69ZZ6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmcc1Q69ZZ6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmcc1Q69ZZ6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmcc1Q69ZZ6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmcc1Q69ZZ6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms