Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM208BQ5VWN6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM208BQ5VWN6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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