Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vwa5b2Q3UR50 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vwa5b2Q3UR50 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vwa5b2Q3UR50 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vwa5b2Q3UR50 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vwa5b2Q3UR50 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vwa5b2Q3UR50 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vwa5b2Q3UR50 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vwa5b2Q3UR50 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vwa5b2Q3UR50 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vwa5b2Q3UR50 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vwa5b2Q3UR50 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vwa5b2Q3UR50 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vwa5b2Q3UR50 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vwa5b2Q3UR50 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vwa5b2Q3UR50 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vwa5b2Q3UR50 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vwa5b2Q3UR50 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vwa5b2Q3UR50 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vwa5b2Q3UR50 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vwa5b2Q3UR50 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vwa5b2Q3UR50 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vwa5b2Q3UR50 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vwa5b2Q3UR50 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vwa5b2Q3UR50 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vwa5b2Q3UR50 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vwa5b2Q3UR50 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vwa5b2Q3UR50 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vwa5b2Q3UR50 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vwa5b2Q3UR50 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vwa5b2Q3UR50 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vwa5b2Q3UR50 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vwa5b2Q3UR50 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms