Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTH7

1500011B03Rik, RIKEN cDNA 1500011B03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1500011B03RikQ3TTH7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1500011B03RikQ3TTH7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms