Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ECM1Q16610 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms