Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PKN1Q16512 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
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