Protein–RNA interactions for Protein: Q12048

ATG41, Autophagy-related protein 41, yeastyeast

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG41Q12048 ATE1YGL017W 1512 nt4.89□□□□□ -1.63
ATG41Q12048 TIM22YDL217C 624 nt4.89□□□□□ -1.63
ATG41Q12048 MNS1YJR131W 1650 nt4.89□□□□□ -1.63
ATG41Q12048 HXT15YDL245C 1704 nt4.89□□□□□ -1.63
ATG41Q12048 HXT16YJR158W 1704 nt4.89□□□□□ -1.63
ATG41Q12048 BRF1YGR246C 1791 nt4.88□□□□□ -1.63
ATG41Q12048 UGO1YDR470C 1509 nt4.88□□□□□ -1.63
ATG41Q12048 HRP1YOL123W 1605 nt4.88□□□□□ -1.63
ATG41Q12048 BIT2YBR270C 1638 nt4.88□□□□□ -1.63
ATG41Q12048 VMA16YHR026W 642 nt4.88□□□□□ -1.63
ATG41Q12048 AAD15YOL165C 432 nt4.88□□□□□ -1.63
ATG41Q12048 ATG12YBR217W 561 nt4.87□□□□□ -1.63
ATG41Q12048 YCL065WYCL065W 369 nt4.86□□□□□ -1.63
ATG41Q12048 YRA1YDR381W 681 nt4.86□□□□□ -1.63
ATG41Q12048 YDR541CYDR541C 1035 nt4.86□□□□□ -1.63
ATG41Q12048 HGH1YGR187C 1185 nt4.86□□□□□ -1.63
ATG41Q12048 FRE3YOR381W 2136 nt4.86□□□□□ -1.63
ATG41Q12048 SGV1YPR161C 1974 nt4.85□□□□□ -1.63
ATG41Q12048 OXP1YKL215C 3861 nt4.85□□□□□ -1.63
ATG41Q12048 MDH3YDL078C 1032 nt4.85□□□□□ -1.63
ATG41Q12048 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt4.85□□□□□ -1.63
ATG41Q12048 YNR048WYNR048W 1182 nt4.85□□□□□ -1.63
ATG41Q12048 MRP51YPL118W 1035 nt4.85□□□□□ -1.63
ATG41Q12048 SLT2YHR030C 1455 nt4.85□□□□□ -1.63
ATG41Q12048 YKR023WYKR023W 1593 nt4.85□□□□□ -1.63
ATG41Q12048 DED81YHR019C 1665 nt4.85□□□□□ -1.63
ATG41Q12048 SHE10YGL228W 1734 nt4.85□□□□□ -1.63
ATG41Q12048 SYG1YIL047C 2709 nt4.84□□□□□ -1.63
ATG41Q12048 HES1YOR237W 1305 nt4.84□□□□□ -1.63
ATG41Q12048 TRP1YDR007W 675 nt4.84□□□□□ -1.63
ATG41Q12048 PGA3YML125C 939 nt4.84□□□□□ -1.63
ATG41Q12048 BPL1YDL141W 2073 nt4.84□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 MRK1YDL079C 1506 nt4.83□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 YHC3YJL059W 1227 nt4.83□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 YOR300WYOR300W 309 nt4.83□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 RRN3YKL125W 1884 nt4.83□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 YFL034WYFL034W 3222 nt4.83□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 QDR1YIL120W 1692 nt4.83□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 TRP5YGL026C 2124 nt4.82□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 YMR027WYMR027W 1413 nt4.82□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 GEP5YLR091W 882 nt4.82□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 YPR195CYPR195C 330 nt4.82□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 STE50YCL032W 1041 nt4.82□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 VTH1YIL173W 4650 nt4.82□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 VTH2YJL222W 4650 nt4.82□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 SHM1YBR263W 1473 nt4.81□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 YDL121CYDL121C 450 nt4.81□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 RML2YEL050C 1182 nt4.81□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 MOG1YJR074W 657 nt4.81□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 LEM3YNL323W 1245 nt4.81□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 UBC4YBR082C 447 nt4.81□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 SNT2YGL131C 4212 nt4.81□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 DBF4YDR052C 2115 nt4.81□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 MRF1YGL143C 1242 nt4.8□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 YJL107CYJL107C 1164 nt4.8□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 snR10snR10 245 nt4.8□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 YOR024WYOR024W 324 nt4.8□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 YPL136WYPL136W 369 nt4.8□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 CTS1YLR286C 1689 nt4.8□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt4.79□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 DFM1YDR411C 1026 nt4.79□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 COX11YPL132W 903 nt4.79□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 FET3YMR058W 1911 nt4.79□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 CRZ1YNL027W 2037 nt4.79□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 SUB2YDL084W 1341 nt4.78□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 YER187WYER187W 426 nt4.78□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt4.78□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 QRI1YDL103C 1434 nt4.78□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 RPT1YKL145W 1404 nt4.78□□□□□ -1.64
ATG41Q12048 SIP5YMR140W 1470 nt4.77□□□□□ -1.65
ATG41Q12048 XPT1YJR133W 630 nt4.77□□□□□ -1.65
ATG41Q12048 ECM19YLR390W 339 nt4.77□□□□□ -1.65
ATG41Q12048 GEP3YOR205C 1671 nt4.77□□□□□ -1.65
ATG41Q12048 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt4.76□□□□□ -1.65
ATG41Q12048 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt4.76□□□□□ -1.65
ATG41Q12048 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt4.76□□□□□ -1.65
ATG41Q12048 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt4.76□□□□□ -1.65
ATG41Q12048 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt4.76□□□□□ -1.65
ATG41Q12048 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt4.76□□□□□ -1.65
ATG41Q12048 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt4.76□□□□□ -1.65
ATG41Q12048 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt4.76□□□□□ -1.65
ATG41Q12048 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt4.76□□□□□ -1.65
ATG41Q12048 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt4.76□□□□□ -1.65
ATG41Q12048 MPM1YJL066C 759 nt4.76□□□□□ -1.65
ATG41Q12048 RPA49YNL248C 1248 nt4.76□□□□□ -1.65
ATG41Q12048 SCO1YBR037C 888 nt4.76□□□□□ -1.65
ATG41Q12048 GRS1YBR121C 2004 nt4.76□□□□□ -1.65
ATG41Q12048 RNR3YIL066C 2610 nt4.76□□□□□ -1.65
ATG41Q12048 KIP2YPL155C 2121 nt4.75□□□□□ -1.65
ATG41Q12048 PDI1YCL043C 1569 nt4.75□□□□□ -1.65
ATG41Q12048 YDR154CYDR154C 351 nt4.75□□□□□ -1.65
ATG41Q12048 PRS2YER099C 957 nt4.75□□□□□ -1.65
ATG41Q12048 PAN6YIL145C 930 nt4.75□□□□□ -1.65
ATG41Q12048 ZRT2YLR130C 1269 nt4.75□□□□□ -1.65
ATG41Q12048 RPS19BYNL302C 435 nt4.75□□□□□ -1.65
ATG41Q12048 ISU2YOR226C 471 nt4.75□□□□□ -1.65
ATG41Q12048 ENV7YPL236C 1095 nt4.75□□□□□ -1.65
ATG41Q12048 DFG5YMR238W 1377 nt4.75□□□□□ -1.65
ATG41Q12048 SED4YCR067C 3198 nt4.75□□□□□ -1.65
ATG41Q12048 HAP1YLR256W 4509 nt4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.8 ms