Protein–RNA interactions for Protein: Q06147

LCB5, Sphingoid long chain base kinase 5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB5Q06147 IRC25YLR021W 540 nt7.53□□□□□ -1.2
LCB5Q06147 RPL10YLR075W 666 nt7.53□□□□□ -1.2
LCB5Q06147 SAS2YMR127C 1017 nt7.53□□□□□ -1.2
LCB5Q06147 YNL017CYNL017C 339 nt7.53□□□□□ -1.2
LCB5Q06147 YPR012WYPR012W 255 nt7.53□□□□□ -1.2
LCB5Q06147 YSA1YBR111C 696 nt7.53□□□□□ -1.2
LCB5Q06147 APM4YOL062C 1476 nt7.53□□□□□ -1.2
LCB5Q06147 VTS1YOR359W 1572 nt7.53□□□□□ -1.2
LCB5Q06147 CRN1YLR429W 1956 nt7.53□□□□□ -1.2
LCB5Q06147 BUD9YGR041W 1644 nt7.52□□□□□ -1.2
LCB5Q06147 PPH21YDL134C 1110 nt7.52□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 TRP1YDR007W 675 nt7.52□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 MNN10YDR245W 1182 nt7.52□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 MPO1YGL010W 525 nt7.52□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 RNA15YGL044C 891 nt7.52□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 YGL235WYGL235W 537 nt7.52□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 OPI1YHL020C 1215 nt7.52□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 STS1YIR011C 960 nt7.52□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 ERP2YAL007C 648 nt7.52□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 UTP30YKR060W 825 nt7.52□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 TIS11YLR136C 858 nt7.52□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 ODC2YOR222W 924 nt7.52□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 NUP84YDL116W 2181 nt7.52□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 TRS23YDR246W 660 nt7.51□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 YJR157WYJR157W 363 nt7.51□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 URA1YKL216W 945 nt7.51□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 YGP1YNL160W 1065 nt7.51□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 GSP2YOR185C 663 nt7.51□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 ERV2YPR037C 591 nt7.51□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 YPR142CYPR142C 564 nt7.51□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 CTF13YMR094W 1437 nt7.51□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 MDM31YHR194W 1740 nt7.5□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 ALG1YBR110W 1350 nt7.5□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 DOC1YGL240W 753 nt7.5□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 TFG2YGR005C 1203 nt7.5□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 RRP46YGR095C 672 nt7.5□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 CPR2YHR057C 618 nt7.5□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 TEF4YKL081W 1239 nt7.5□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 YKL115CYKL115C 393 nt7.5□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 PRY2YKR013W 990 nt7.5□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 YLR112WYLR112W 420 nt7.5□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 CDC123YLR215C 1083 nt7.5□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 RPN5YDL147W 1338 nt7.5□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt7.5□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt7.5□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 MST1YKL194C 1389 nt7.49□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 PHM8YER037W 966 nt7.49□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 YGL260WYGL260W 231 nt7.49□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 YHR173CYHR173C 339 nt7.49□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 YJR142WYJR142W 1029 nt7.49□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 YOX1YML027W 1158 nt7.49□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 SUR1YPL057C 1149 nt7.49□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 MSI1YBR195C 1269 nt7.49□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 HAL5YJL165C 2568 nt7.49□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 YNR066CYNR066C 1311 nt7.49□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 STF1YDL130W-A 261 nt7.48□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 YDL162CYDL162C 357 nt7.48□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 YDR215CYDR215C 414 nt7.48□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 MRF1YGL143C 1242 nt7.48□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 YIP5YGL161C 933 nt7.48□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 SPO7YAL009W 780 nt7.48□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt7.48□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 ELF1YKL160W 438 nt7.48□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 NTR2YKR022C 969 nt7.48□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 YLL059CYLL059C 507 nt7.48□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 PML39YML107C 1005 nt7.48□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 RRN10YBL025W 438 nt7.48□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 SEN15YMR059W 387 nt7.48□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 CPA1YOR303W 1236 nt7.48□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 YPR071WYPR071W 636 nt7.48□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 KAR4YCL055W 1008 nt7.48□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 CLD1YGR110W 1338 nt7.48□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 RSP5YER125W 2430 nt7.48□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 YPL245WYPL245W 1365 nt7.47□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 SKY1YMR216C 2229 nt7.47□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 SPO77YLR341W 1434 nt7.47□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 RRP43YCR035C 1185 nt7.47□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 YDL026WYDL026W 312 nt7.47□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 DST1YGL043W 930 nt7.47□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 YGL081WYGL081W 963 nt7.47□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 YJR011CYJR011C 786 nt7.47□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 YKL123WYKL123W 381 nt7.47□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 YKL147CYKL147C 618 nt7.47□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 CAR2YLR438W 1275 nt7.47□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 NRK1YNL129W 723 nt7.47□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 GAL7YBR018C 1101 nt7.47□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 PNG1YPL096W 1092 nt7.47□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 YBR071WYBR071W 636 nt7.47□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 STE3YKL178C 1413 nt7.46□□□□□ -1.21
LCB5Q06147 YDR249CYDR249C 1122 nt7.46□□□□□ -1.22
LCB5Q06147 LRS4YDR439W 1044 nt7.46□□□□□ -1.22
LCB5Q06147 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt7.46□□□□□ -1.22
LCB5Q06147 ERP5YHR110W 639 nt7.46□□□□□ -1.22
LCB5Q06147 CDC11YJR076C 1248 nt7.46□□□□□ -1.22
LCB5Q06147 MAP1YLR244C 1164 nt7.46□□□□□ -1.22
LCB5Q06147 PTH2YBL057C 627 nt7.46□□□□□ -1.22
LCB5Q06147 MFA2YNL145W 117 nt7.46□□□□□ -1.22
LCB5Q06147 REX4YOL080C 870 nt7.46□□□□□ -1.22
LCB5Q06147 YOR024WYOR024W 324 nt7.46□□□□□ -1.22
LCB5Q06147 YBR063CYBR063C 1215 nt7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 79.1 ms